Un nanovirus est découvert dans l'épisode
Virus (Hot Zone) : alors que les membres d'Atlantis vérifient les dégâts infligés à la cité lors de
En pleine tempête partie 2 (The Eye), deux scientifiques meurent après avoir eu des hallucinations. Très vite,
McKay se rend compte que dans un des laboratoires des fioles ont été brisées et qu'un nanovirus s'est répandu. Très vite d'autres personnes souffrent des premiers symptômes et commencent à décéder.